长沙市疾病预防控制中心是实施政府公共卫生职能的核心专业机构，担负着对疾病、残疾和伤害的预防控制，创造健康环境，维护社会稳定，保护国家安全，促进人民健康的历史使命。始终坚持“预防为主，守护健康”的宗旨，突出“让公众健康、让疾控卓越、让人生精彩”的疾控人共同价值观，默默奉献，执着耕耘，守护着星城八百万人民的健康，逐步实现了疾控事业的跨越式发展。
历经六十余年的探索与奋斗，在市委、市政府的重视关心下，长沙先后消灭了天花、白喉，控制了脊髓灰质炎、疟疾、血吸虫病、碘缺乏病、地氟病的流行，战胜了非典型性肺炎、人禽流感、甲型H1N1流感、手足口病等新发传染病的肆虐，成功处置了多起重大突发公共卫生事件，构建了疾病预防控制信息网络，推进实施基本公共卫生服务均等化，全市人均期望寿命从1949年的35岁跃升至2015年的77.14岁，人民群众健康水平显著提升。
近年来，站在新的历史起点，长沙疾控全力秉承“强基固本，中和内外”的发展理念，大力实施“科技强疾控，人才兴疾控”发展战略，严格遵循“依法科学，严谨规范，优质高效，公正诚信”的质量方针，作为全市疾病预防控制的业务技术服务与指导中心，围绕疾病预防控制重点任务，逐渐形成了具有自身优势的区域性公共卫生服务技术支撑平台，在防病、应急、公共卫生信息能力的建设等方面发挥应有的作用。
基本职能：
疾病预防与控制：传染病、职业病、寄生虫病、地方病、慢性与非传染病预防与控制；
突发公共卫生事件应急处置：物资与技术储备，报告与预警，处置与评估；
疫情及健康相关因素信息管理：疾病预防控制信息平台建设及信息系统管理；
健康危害因素监测与控制：职业、放射、环境危害因素监测与控制，食品安全与食源性疾病预防控制、营养监测与营养改善，学生常见病预防与控制，病媒生物监测与控制，公共卫生监测与健康安全评价，PM2.5有害成分以及对人群危害监测；
实验室检测评价分析：实验室管理与质量控制、微生物与寄生虫病检验、理化检验、毒理检测与评价；
健康教育与健康促进：卫生防病知识的普及，健康指导，行为干预；
技术指导与应用研究：健康技术培训、指导、服务，科学研究，新技术推广。